Computational Regulatory Genomics

Publications (2015)

Transcriptional control of tissue formation throughout root development

M. Moreno-Risueno,  R. Sozzani,  Gurkan Yardimci,  J. Petricka,  T. Vernoux,  I. Blilou,  J. Alonso,  C. Winter,  Uwe Ohler,  B. Scheres,  P. Benfey 
Science 2015;   DOI  

Perspectives on Unidirectional versus Divergent Transcription

S. Duttke,  Scott Allen Lacadie Mahmoud Ibrahim,  C. Glass,  D. Corcoran,  C. Benner,  S. Heinz,  J. Kadonaga,  Uwe Ohler 
Mol. Cell 2015;   DOI   PubMed  

Regnase-1 and Roquin Regulate a Common Element in Inflammatory mRNAs by Spatiotemporally Distinct Mechanisms

T. Mino,  Y. Murakawa,  A. Fukao,  A. Vandenbon,  Hans-Hermann Wessels,  D. Ori,  T. Uehata,  S. Tartey,  S. Akira,  Y. Suzuki,  C. Vinuesa,  Uwe Ohler,  D. Standley,  M. Landthaler,  T. Fujiwara,  O. Takeuchi 
Cell 2015;   DOI   PubMed  

Human Promoters Are Intrinsically Directional

S. Duttke,  Scott Allen Lacadie Mahmoud Ibrahim,  C. Glass,  D. Corcoran,  C. Benner,  S. Heinz,  J. Kadonaga,  Uwe Ohler 
Molecular Cell 2015;   DOI   PubMed  

JAMM: a peak finder for joint analysis of NGS replicates

Mahmoud Ibrahim Scott Allen Lacadie Uwe Ohler 
Bioinformatics 2015;   DOI   PubMed  
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